Wirbelzähler werden normalerweise nicht für Chargen- oder andere intermittierende Durchflussanwendungen empfohlen. Dies liegt daran, dass die Einstellung der Tropfdurchflussrate der Mischstation unter den minimalen Reynoldszahl-Grenzwert des Messgeräts fallen kann. Je kleiner die Gesamtcharge ist, desto schwerwiegender dürfte der daraus resultierende Fehler sein.

Gase mit niedrigem Druck (niedriger Dichte) erzeugen keinen ausreichend starken Druckimpuls, insbesondere wenn die Flüssigkeitsgeschwindigkeit niedrig ist. Daher ist es wahrscheinlich, dass bei solchen Diensten die Reichweite des Messgeräts schlecht ist und geringe Durchflussmengen nicht messbar sind. Wenn andererseits ein reduzierter Messbereich akzeptabel ist und das Messgerät die richtige Größe für normalen Durchfluss hat, kann der Wirbeldurchflussmesser dennoch in Betracht gezogen werden.

Wenn die Prozessflüssigkeit dazu neigt, den Staukörper zu beschichten oder anzusammeln, wie es bei Schlamm- und Schlammanwendungen der Fall ist, wird dies letztendlich den K-Faktor des Messgeräts verändern. Wirbelablösende Durchflussmesser werden für solche Anwendungen nicht empfohlen. Wenn eine verschmutzte Flüssigkeit jedoch nur mäßige Mengen nicht beschichtender Feststoffe enthält, ist die Anwendung wahrscheinlich akzeptabel. Dies wurde durch einen 2-jährigen Test an einer Kalksteinaufschlämmung nachgewiesen. Am Ende des Tests wurde festgestellt, dass sich der K-Faktor gegenüber der ursprünglichen Werkskalibrierung nur um 0,3 % verändert hatte, obwohl der Staukörper und das Durchflussrohr stark vernarbt und narbig waren.

Bei der Messung von Mehrphasenströmungen (feste Partikel in Gas oder Flüssigkeit; Gasblasen in Flüssigkeit; Flüssigkeitströpfchen in Gas) nimmt die Genauigkeit des Wirbelmessgeräts ab, da das Messgerät nicht in der Lage ist, zwischen den Phasen zu unterscheiden. Nassdampf von geringer Qualität ist eine dieser Anwendungen: Die flüssige Phase sollte homogen im Dampf verteilt sein und vertikale Strömungslinien sollten vermieden werden, um Flüssigkeitsschläge zu vermeiden. Wenn das Rohr horizontal ist, bewegt sich die flüssige Phase wahrscheinlich am Boden des Rohrs, weshalb der Innenbereich des Rohrs am Boden offen gehalten werden sollte. Dies kann durch den horizontalen Einbau des Staukörpers erreicht werden. Die Messungenauigkeit bei solchen Anwendungen beträgt etwa 5 % des tatsächlichen Durchflusses, jedoch bei guter Wiederholbarkeit.

Der permanente Druckverlust durch einen Wirbelzähler beträgt etwa die Hälfte des Druckverlusts einer Blende, etwa zwei Geschwindigkeitshöhen. (Eine Geschwindigkeitshöhe ist als V2/g definiert, wobei V die Strömungsgeschwindigkeit und g die Gravitationskonstante in konsistenten Einheiten ist.) Wenn Rohr und Messgerät richtig dimensioniert sind und die gleiche Größe haben, ist der Druckabfall wahrscheinlich nur gering ein paar psi. Allerdings kann eine Verkleinerung (Installation eines Messgeräts, das kleiner als die Leitungsgröße ist) zur Erhöhung des Reynolds-Werts den Druckverlust auf mehr als 10 psi erhöhen. Außerdem sollte darauf geachtet werden, dass der Vena-Contracta-Druck nicht unter den Dampfdruck der Prozessflüssigkeit absinkt, da dies zu Kavitation führen würde. Wenn der Gegendruck am Messgerät unter dem Dampfdruck liegt, kommt es natürlich zum Verdampfen der Prozessflüssigkeit und der Messwert des Messgeräts ist nicht aussagekräftig.